弗瑞见状没有多说，因为他们的时间不多了。
史蒂夫非常清楚这群九头蛇的作风，皮尔斯现在失踪了，只要一段时间没有出现，那他设置好的后手就会立即启动。
因此他们必须要在后手启动前，尽可能的消灭大量的九头蛇特工。
很快他们就抓住了藏有名单的九头蛇特工，这名特工在神盾局之中是专门负责打杂的，平常也是非常低调，甚至可以说是无名小子，但就是这样普普通通的家伙，却掌控着所有九头蛇特工的名单。
尽管他一开始抵赖，但被注射了吐真剂后，他也就供出了名单的位置。
拿到名单后，弗瑞，科尔森立即开始准备，首先是让贾维斯通知了所有不是九头蛇的领导层，将各自手下的九头蛇名单发给了他们，让他们立即将其控制住。
接着便是各个基地的长官，他们纷纷收到了名单，收到名单的第一反应就是中了病毒，直到弗瑞一个个联系他们，他们这才清楚，这不是演戏，也不是演习，更不是开玩笑。
随即各个部门展开了雷厉风行的剿蛇行动，此时距离皮尔斯失踪已经过去了五个小时，他所准备的后手也已经启动了。
所有九头蛇成员也收到了消息，那就是他们暴露了，所有人立即启动。
只是他们的高层早就被控制了，为此中层开始接手，还有就是神盾局外的九头蛇高层立即接手，让他们指挥这些九头蛇。
得到命令的九头蛇，开始在三曲翼总部之中收集各种科研数据，抢走各种先进的武器装备，同时打算搞破坏。
而就在这时，托尼率领着妇联众人降临了三曲翼大厦，神盾局组成的特工们也立即赶了过来，但整个神盾局的快速反应部队都是九头蛇的人，还有就是外勤部队大多数也是九头蛇的人。
因此神盾局特工完全不是九头蛇特工的对手，毕竟他们需要出外勤，实力方面自然是要比他们强得多。
但是有着复联的加入后，神盾局特工也就停止了颓势，反而还敢发起了反冲锋。
就在众人都在三曲翼大厦内抢夺地盘的时候，一群又一群九头蛇特工，通过三曲翼大厦中的秘密通道来到了停机坪。
等到众人差不多都到了之后，朗姆洛，也就是交叉骨一声令下，让众人登上战机。
“不等他们吗？”
“他们死定了，不过他们能够为了让我们活下来而牺牲，也算是他们死得其所了，九头蛇万岁！”
“九头蛇万岁！”
随即众人登上了战机，伴随着停机坪上方的天花板被打开，一架架型号各异的战斗机被开走，托尼也知道他们被摆了一道，但想要追击，却为时已晚了，九头蛇离开的时候还安放了炸弹，将剩余没办法开走的战机全部炸毁了。
他们已经没有别的手段追击他们了，为此他们只能是将怒火放在了这些还在负隅顽抗的九头蛇特工身上。
最终他们在没有影响到其他区域的情况下，将大量九头蛇特工全部歼灭，但还是跑了很多，这些逃走的九头蛇以快速反应部队以及外勤部门为主。
解决完他们后，弗瑞还需要去应对理事国呢。
面对理事国的刁难，弗瑞轻松化解，同时还给神盾局要来了更多的资金，就这样九头蛇的事件，在弗瑞的控制下，几乎没有闹出什么大动静就结束了，并且还让九头蛇彻底沦为了恐怖组织，受全球国家的追捕。
九头蛇也因此开始想办法隐藏行踪，避免被人发现，同时许多计划也因此夭折了，就连复联也将巴基找了回来，接下来要做的就是让巴基脱离洗脑，在此期间，托尼总是找借口揍巴基一顿，大家都明白托尼为什么这么做，为此他们并没有阻拦。