临塞城东王家坳一役，秦武以少胜多，阵斩乌戎百夫长，其卓越的军事才能与麾下士卒强悍的战力，彻底折服了萧远以及军中所有将士。萧远心中对秦武的倚重与信任，亦是与日俱增。
经过数日的深思熟虑，萧远做出了一个令军中许多旧部都颇感意外的决定。他正式召集军中所有校尉以上的军官，当众宣布，擢升秦武为军中副将，全权负责整支军队的日常操练、军纪整肃及战术研习事宜。
老将张猛对秦武已是心服口服，闻此任命，非但毫无异议，反而主动请缨，愿为秦武之副手，全力协助推行新法练兵。
自此，秦武真正掌握了萧远麾下这千余兵马的训练大权。他深知，这支军队虽经一场胜仗鼓舞，但其根基依然薄弱，积弊沉重，若要将其打造成一支真正的精锐之师，非下一番刮骨疗毒般的苦功不可。
上任伊始，秦武便在校场之上高筑将台，召集全军将士，颁布了由他亲自制定的《奋武军军纪铁律十二条》。
其律令之严苛，细节之繁琐，远超以往。从营房内务，被褥叠放如豆腐块，兵甲擦拭一尘不染；到军容风纪，衣衫整洁，行止有度；再到作息号令，闻鼓即起，闻金则止，不得有片刻延误。更有“战场抗命者，斩！”“临阵脱逃者，斩！”“奸淫掳掠者，斩！”等数条红线，清晰明确。
“军无纪，不成军！自今日起，凡我奋武军将士，皆需恪守军纪。王子犯法，与庶民同罪！若有违者，莫怪本将手中军法无情！”秦武立于高台，声如洪钟，目光如电，扫过下方每一名士卒。
起初，不少老兵油子对此不以为然，以为不过是新官上任三把火。然则，不过三日，便有一队老兵在夜间操练结束后，私自聚在营帐饮酒喧哗，被秦武亲率巡营的吴云山逮个正着。秦武二话不说，当着全营将士的面，将那为首的队率以及几名闹得最凶的老兵，各抽了二十军棍，打得皮开肉绽，哀嚎不已。
并当场宣布，革去那队率之职，降为普通士卒。如此雷霆手段，立时震慑了全军，再无人敢小觑这十二条军纪铁律。
萧远在帅帐之中听闻此事，只是微微颔首，对秦武这般铁腕治军，他不仅不反对，反而颇为赞赏。他深知，慈不掌兵，一支没有铁的纪律的军队，不过是一群乌合之众。
纪律既立，秦武便将重心转向了体能的锤炼。
秦武依据士卒的体力、技能特长，将其划分为不同兵种：体格强壮、耐力出众者编入重甲步兵营，负责正面冲击与坚守；臂力过人、目力敏锐者，则选入弓弩营，加强远程打击能力；原有的少量骑兵，加上从秦家湾带来的骑兵骨干，以及挑选出的善骑射者，扩编为一支精锐骑兵营，由吴云山直接统领，作为战场上的尖刀；而徐果儿和秦冲，则分别统领两个主力步兵营，严格按照秦武教授的三三制战术小组进行日常操练；此外，秦武还挑选了一批机灵、腿脚快的士兵，组建了斥候队，由李云、李二宝这两位原保宁军精锐负责训练，专门学习潜伏、侦察、传递军情等技能；甚至，他还从军中挑选了一些略懂修葺、挖掘的士兵，以及部分被俘的乌戎工匠，组建了小规模的工兵队雏形，负责修筑工事、铺设道路等。
新的训练方法一开始，自然也遇到不少阻力。许多老兵油子习惯了以往松散的日子，对秦武严苛的体能训练（每日清晨的长途奔跑、翻越障碍）、枯燥的队列操练以及复杂的分队战术配合颇有怨言，认为这是花架子，不切实际。
“他娘的，跑个步还能跑死乌戎人不成”
“这站军姿，比上阵杀敌还累！”