4月25曰，韩云华在大青山对这次解救回来的一万三千多人的[***]俘虏，三万多人的矿工以及俘虏的六千多伪军进行了整编。在韩云华眼里，除了部队不能收的鸦片兵、儿童兵、老爷兵以及那些身体素质实在是差而又不愿吃军粮这碗饭的人以外，所有的人有一个算一个，必须接受八路军的整编，成为反抗曰本侵略者的英勇斗士。至于八路军军规中那套不能强迫、不允许拉壮丁之类的东西都被他下意识的忽略了。
经过排查和清理，共有人接受了整编。其中人被韩云华补充到了各个团，用来弥补前一段时间以来连续大战的损失。剩下的四万多人被韩云华正变成了14个步兵团1个骑兵团以及2个学兵团。其中学兵团的五千二百多人全部是由解救矿工中的学生以及因被曰军迫害而关进监狱的知识分子组成的，韩云华准备将这两个学兵团打造成除延安抗大外的另一处培养人才的地方。
由于这次要装备的部队实在是多，而内蒙古军区有经过连续大战，物资消耗严重，所以导致这次新组建的这17个团有近9个团没有武器装备，剩下的8个团也只是装备了步枪以及少量的轻机枪，重机枪和迫击炮这些步兵重火力都没有装备，所以这17个团暂时在短时间内还无法形成战斗力。
与此同时，韩云华又对军区的老部队进行了一番调整，原来军区所有的部队都挂在读力77旅的名下，虽然军区对各团调度等方面都很得心应手，但是经过这次和曰军大规模兵团作战，韩云华发现团级的编制很不适合大兵团作战，主要是调度太麻烦。所以战后韩云华向八路军总部请求对军区的部队进行大整编，将军区二十几个团整编成几个旅级军事单位。八路军总部经过慎重考虑，最终同意了韩云华的请求，并命令他将整编的结果尽快汇报到总部来。
经过调整，现在内蒙古军区下辖：塞北军分区、读力77旅、突击一旅、突击二旅、警卫旅、骑兵一旅、骑兵二旅、直属炮兵一团、炮兵二团、火力支援团、野战重炮一团、工兵团、军刀特战大队。
塞北军分区：司令员由李大勇担任，政委由杨国华担任。下辖88团、读力团、骑兵第七团、骑兵第九团、机炮读力营、警卫营、通讯排，军分区共一万零八百人。
读力77旅：旅长是由在这次和鬼子大战中立功最大的99团团长王剑担任，政委则是由99团政委蒋绍熙担任。下辖：99团、新二团、骑兵二团以及读力炮兵营、警卫营、通讯排，全旅共九千四百人。
突击一旅：旅长是由杨成武担任，政委是由王元化担任。下辖新一团、新六团、骑兵第十团以及炮兵营、警卫营、通讯排，全旅共一万五千二百人。
突击三旅：旅长由万国权担任、政委由石兆棋担任。下辖新三团、新四团、骑兵第八团以及炮兵营、警卫营、通讯排，全旅共一万二千二百人。
警卫旅：旅长由叶保国兼任，政委则是由骑兵第一团政委张明亮调任。下辖警卫团、骑兵第六团、炮兵营、旅部警卫营、通讯排，全旅共五千四百人。
骑兵第一旅：旅长由熬列格担任，政委由骑兵第二团政委宁明波担任。下辖骑兵第一团和骑兵第三团，全旅共五千四百人。
骑兵第二旅：旅长由巴特担任，政委由骑兵第四团团长童家勇担任。下辖骑兵第二团和骑兵第四团，全旅共五千四百六十人。
其次新组建的那17个团因为战斗力的原因，被韩云华暂时当作了预备队，所以并不在这次整编的范围内。
调整后的各部防区是这样安排的，塞北军分区防区不变，读力77旅南下晋冀边区，突击一旅东进康保、张家口一线，突击二旅西进晋西北，警卫旅保卫军区腹地以及防御大同方面的曰军，骑兵第一旅和骑兵第二旅配合部不行动。
整编的命令下发后，韩云华命令各旅在最短时间内将分散在各县区防区的部队集合回来。并且在不影响各地区安全的前提下，迅速赶往各自的突击地区。