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“李定国接到永历帝之后，悄然退兵入云南，避开了和孙可望全面冲突。
永历帝改昆明为滇都，再立朝廷，封李定国为晋王，交托军国大事。
李定国虽掌管大权，但对永历帝十分尊敬，不敢丝毫逾越。
只是他用人不当，任命了金维新为吏部侍郎兼督察御史，结果这货又是一个搞内斗的好手，弄得南明朝廷内讧不断。
对待孙可望，李定国仍旧以大局为重，不断派人劝说孙可望，希望能够和解，共同抗击清军，恢复大明。
但孙可望仍旧一意孤行，执意要打李定国，还扣押了使者白文选和他的部队。
孙可望部下马进忠、马宝、马惟兴等人密谋帮助李定国，忽悠孙可望归还了白文选兵权。
随后，孙可望领十四万大军进逼交水，李定国，刘文秀领五万军队对峙两岸。
李定国仍然希望不要内讧，不想发起最后的决战。
但白文选派人告诉李定国，大家都准备好了，再不打，就要吃大亏了。
于是，双方正式最后的决战！
决战时，孙可望命白文选出战，结果白文选带着兵马直接冲向了马惟兴，马军则又直冲孙可望大营！
孙军大乱，李定国立马进攻，孙军各大营纷纷投降，大喊迎晋王。
内战平息！
孙可望只带着几十个亲信逃跑，沿途所过诸镇守将皆闭门不搭理他。
最后，孙可望投降了洪承畴，被清廷封为义王！
1660年，孙可望随顺治帝狩猎，被清军“误伤”，中箭不治，病死！”
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“好，好，好个误伤！狗腿子！”
看到孙可望的结局，朱元璋直拍手称快！
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崇祯时代，张献忠大营。
张献忠同样是拍着手，道：
“搞内斗是吧？投降满清是吧？误伤，哈哈哈，来人，把这个逆子给我绑起来，我好久没射箭了。”
孙可望大惊失色，道：“父帅，饶命，冤枉啊，孩儿没做这些事情啊，都是污蔑啊。”
张献忠道：“污蔑，这是天神的启示，你是个什么东西，天神污蔑你？来人，给我绑起来，我只射一箭，若是你能活，那我就放了你！”
孙可望吓得浑身颤抖，他环顾其他人，然后看到了一脸愤怒的李定国。
“二弟，二弟，我真的是冤枉的啊，我不会害你的啊，我不会害你的啊，我是你大哥啊！”
李定国有些不忍，便看向了张献忠。
张献忠道：“老二，你不要给他求情，你看看你，要是一早就把这孽障杀了，哪有后来那么多事！
今日，我就在此宣布，以后，倘若我不在了，你们必须以老二为尊，一切都要他的。”
随后，孙可望被人绑在了大营外面。
张献忠抬起弓箭，瞄准了孙可望，孙可望仍然在不断的求饶。
张献忠将双眼通红，闭上了眼睛，眼角流下了一滴泪水。
随后，他的手抖了一下，松开了箭矢！
怎料，这时候突然刮起一阵风！
紧接着，一声惨叫传来，箭矢准确无误的插在了孙可望的脖子上。
张献忠将弓箭丢到地上，道：“天要杀你，死有余辜！”
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“交水之战后，李定国论功行赏，犒赏三军，但因为对于孙可望的恼怒，将原本孙可望的降军称为秦军，自已的部队称为晋军，导致了原孙可望旗下许多将领不满。
同时他认为那些军队都是懒兵，斥责刘文秀用他们来镇守边境不可靠，并召回了刘文秀训话。
刘文秀心灰意冷，第二年郁郁而终，南明政权实力大损！
同时，因为孙可望投降，向洪承畴献出了西南地图，南明虚实被洪承畴彻底掌握。
清廷派出三路大军围攻贵州，但此时李定国正在镇压叛乱，无暇他顾，致使清军在贵州站稳了脚跟。
而后，李定国联系李来亨和夔门十三家一起对抗清军。
但这一次，他布置失误了。